Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PtprbB2RU80 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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