Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms