Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed5B2RPU8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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