Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms