Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr29B1ARI9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms