Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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