Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms