Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms