Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pramef6A2A8M8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms