Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms