Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrQ9WUZ7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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