Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Stub1Q9WUD1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Stub1Q9WUD1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms