Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms