Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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