Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms