Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms