Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trem1Q9JKE2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms