Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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