Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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