Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms