Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms