Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4bQ9D8B3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms