Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms