Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms