Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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