Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krt20Q9D312 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms