Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms