Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms