Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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