Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms