Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim26Q99PN3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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