Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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