Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms