Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfdQ925I7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms