Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf144aQ925F3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms