Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tdrd3Q91W18 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tdrd3Q91W18 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tdrd3Q91W18 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tdrd3Q91W18 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tdrd3Q91W18 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms