Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms