Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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