Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Top1mtQ8R4U6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top1mtQ8R4U6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1mtQ8R4U6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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