Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms