Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Arhgap29Q8CGF1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap29Q8CGF1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms