Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fbxo48Q8CAT8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fbxo48Q8CAT8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fbxo48Q8CAT8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms