Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9958Q8C9U4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms