Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubqln3Q8C5U9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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