Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms