Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpcpd1Q8C0L9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms