Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctdsp2Q8BX07 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms