Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hirip3Q8BLH7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms