Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms