Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NanogQ80Z64 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NanogQ80Z64 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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